MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	CAAC	2	8	47	54	50 %	0 %	0 %	50 %	436669980
2	NC_020050	TCAGCA	2	12	124	135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436669980
3	NC_020050	AGGA	2	8	174	181	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
4	NC_020050	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669980
5	NC_020050	TCA	2	6	249	254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
6	NC_020050	AG	3	6	313	318	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
7	NC_020050	GCT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
8	NC_020050	TGA	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
9	NC_020050	AT	3	6	364	369	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
10	NC_020050	GTT	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669980
11	NC_020050	A	8	8	450	457	100 %	0 %	0 %	0 %	436669980
12	NC_020050	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
13	NC_020050	GAA	2	6	605	610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
14	NC_020050	CGC	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
15	NC_020050	TCG	2	6	637	642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
16	NC_020050	AGCGC	2	10	709	718	20 %	0 %	40 %	40 %	436669980
17	NC_020050	GTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
18	NC_020050	GCCG	2	8	761	768	0 %	0 %	50 %	50 %	436669980
19	NC_020050	GAG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
20	NC_020050	GAA	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
21	NC_020050	AAG	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
22	NC_020050	GATG	2	8	949	956	25 %	25 %	50 %	0 %	436669980
23	NC_020050	TGCT	2	8	978	985	0 %	50 %	25 %	25 %	436669980
24	NC_020050	CCA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669980
25	NC_020050	CGT	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
26	NC_020050	CAG	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
27	NC_020050	TAG	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
28	NC_020050	AT	3	6	1210	1215	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
29	NC_020050	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
30	NC_020050	CTAAA	2	10	1269	1278	60 %	20 %	0 %	20 %	436669980
31	NC_020050	AGA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
32	NC_020050	ATCG	2	8	1316	1323	25 %	25 %	25 %	25 %	436669980
33	NC_020050	ACAG	2	8	1370	1377	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
34	NC_020050	AG	3	6	1385	1390	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
35	NC_020050	GA	4	8	1406	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
36	NC_020050	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
37	NC_020050	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
38	NC_020050	AGA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
39	NC_020050	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
40	NC_020050	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
41	NC_020050	AGG	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
42	NC_020050	GAA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
43	NC_020050	CGC	2	6	2084	2089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
44	NC_020050	CTG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
45	NC_020050	GAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
46	NC_020050	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
47	NC_020050	AAT	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669980
48	NC_020050	TTC	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669980
49	NC_020050	CGA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
50	NC_020050	ACGA	2	8	2637	2644	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
51	NC_020050	TGA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
52	NC_020050	CTG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
53	NC_020050	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
54	NC_020050	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669981
55	NC_020050	TAG	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
56	NC_020050	TGG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669981
57	NC_020050	TTG	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669981
58	NC_020050	TGC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
59	NC_020050	CT	4	8	3074	3081	0 %	50 %	0 %	50 %	436669981
60	NC_020050	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669981
61	NC_020050	TAT	2	6	3196	3201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
62	NC_020050	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	436669981
63	NC_020050	GAT	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
64	NC_020050	AAG	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669981
65	NC_020050	ATA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669982
66	NC_020050	AGT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669982
67	NC_020050	CAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669982
68	NC_020050	CTT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669982
69	NC_020050	T	6	6	4251	4256	0 %	100 %	0 %	0 %	436669982
70	NC_020050	CCAG	2	8	4307	4314	25 %	0 %	25 %	50 %	436669982
71	NC_020050	CATC	2	8	4335	4342	25 %	25 %	0 %	50 %	436669982
72	NC_020050	AT	3	6	7597	7602	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
73	NC_020050	AGT	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
74	NC_020050	TAA	2	6	7662	7667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
75	NC_020050	ACA	2	6	7709	7714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
76	NC_020050	ATT	2	6	7723	7728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669983
77	NC_020050	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669983
78	NC_020050	TCT	2	6	7801	7806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669983
79	NC_020050	TGT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669983
80	NC_020050	TAG	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
81	NC_020050	AAT	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
82	NC_020050	TAAT	2	8	7974	7981	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
83	NC_020050	AGT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
84	NC_020050	TA	3	6	8082	8087	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
85	NC_020050	CCA	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669983
86	NC_020050	ATTT	2	8	8197	8204	25 %	75 %	0 %	0 %	436669983
87	NC_020050	CAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
88	NC_020050	TAA	2	6	8283	8288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
89	NC_020050	ATCT	2	8	8295	8302	25 %	50 %	0 %	25 %	436669983
90	NC_020050	CT	3	6	8320	8325	0 %	50 %	0 %	50 %	436669983
91	NC_020050	AGA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669983
92	NC_020050	ACTT	2	8	8370	8377	25 %	50 %	0 %	25 %	436669983
93	NC_020050	AC	3	6	8393	8398	50 %	0 %	0 %	50 %	436669983
94	NC_020050	ACAAG	2	10	8488	8497	60 %	0 %	20 %	20 %	436669983
95	NC_020050	CAA	2	6	8516	8521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
96	NC_020050	TGG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669983
97	NC_020050	T	6	6	8558	8563	0 %	100 %	0 %	0 %	436669983
98	NC_020050	GAT	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
99	NC_020050	A	7	7	8663	8669	100 %	0 %	0 %	0 %	436669983
100	NC_020050	AGT	2	6	8681	8686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
101	NC_020050	CTA	2	6	8712	8717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669983
102	NC_020050	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
103	NC_020050	AGG	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669984
104	NC_020050	AT	3	6	8852	8857	50 %	50 %	0 %	0 %	436669984
105	NC_020050	AGA	2	6	8859	8864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
106	NC_020050	GAA	2	6	8950	8955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
107	NC_020050	CTA	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669984
108	NC_020050	AGGT	2	8	9011	9018	25 %	25 %	50 %	0 %	436669984
109	NC_020050	TGA	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669984
110	NC_020050	GAC	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669984
111	NC_020050	A	6	6	9402	9407	100 %	0 %	0 %	0 %	436669984
112	NC_020050	CCA	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669984
113	NC_020050	CGT	2	6	9523	9528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669984
114	NC_020050	GCA	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669984
115	NC_020050	CTCA	2	8	9593	9600	25 %	25 %	0 %	50 %	436669984
116	NC_020050	ACA	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669984
117	NC_020050	TGA	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669984
118	NC_020050	AGC	2	6	9921	9926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669985
119	NC_020050	TAT	2	6	10053	10058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669985
120	NC_020050	TGAAG	2	10	10164	10173	40 %	20 %	40 %	0 %	436669985
121	NC_020050	AAT	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669985
122	NC_020050	ATC	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669985
123	NC_020050	TGA	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669985
124	NC_020050	GA	3	6	10335	10340	50 %	0 %	50 %	0 %	436669985
125	NC_020050	TTG	2	6	10355	10360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669985
126	NC_020050	TAAT	2	8	10599	10606	50 %	50 %	0 %	0 %	436669986
127	NC_020050	TCGC	2	8	10717	10724	0 %	25 %	25 %	50 %	436669986
128	NC_020050	T	7	7	10786	10792	0 %	100 %	0 %	0 %	436669986
129	NC_020050	ACC	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669986
130	NC_020050	GCTAGG	2	12	10808	10819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436669986
131	NC_020050	TGG	2	6	10883	10888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669986
132	NC_020050	TGG	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669986
133	NC_020050	T	6	6	10949	10954	0 %	100 %	0 %	0 %	436669986
134	NC_020050	GTTT	2	8	11062	11069	0 %	75 %	25 %	0 %	436669986
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